Призрак в доспехах: Синдром одиночки

9-й отдел общественной безопасности — элитное спецподразделение, подчинённое напрямую премьер-министру. Его бросают освободить высокопоставленного чиновника из рук захватчиков, но майору Мотоко Кусанаги во всём этом чудится неладное.

Тяжёлая промышленность «Кэнбиси» построила новейший многоногий танк — вот только он вышел из-под контроля и двинулся сам по себе. Силы самообороны умывают руки, и остановить машину, а заодно понять, отчего она взбесилась, приходится Мотоко, Бато и остальным из 9-го отдела.

Андроидов модели GA07_JL, прозванных владельцами «Джери», поразил вирус, и все они один за другим «кончают с собой». 9-й отдел берётся за дело: след может тянуться к вирусу, найденному в андроиде из здания парламента.

Засидевшись на работе, Тогуса получает звонок от бывшего сослуживца из полиции. Тот наткнулся на что-то странное в работе спецгруппы по делу Смеющегося человека — но, не успев встретиться с Тогусой, погибает в автокатастрофе.

Смеющийся человек, объявившийся после шести лет молчания, грозит убить генерального суперинтенданта полиции. Арамаки, однако, подозревает, что это лишь ширма, и знакомит 9-й отдел с главным подозреваемым — Нанао-А, гениальным программистом, создавшим микромашины, на которых держится корпорация «Серано».

Пока Тогуса и Бато выслеживают Нанао, Мотоко и Пас охраняют суперинтенданта на пресс-конференции о злоупотреблениях полиции. Когда вирус всё же наносит удар, счёт идёт на секунды, а след Нанао-А заводит в тупик.

9-й отдел идёт по следу Марсело Джарти, южноамериканского героя-революционера, прибывшего в Японию. Поймать его непросто: Джарти пускает вместо себя двойников — но на этот раз отдел уверен, что перед ними настоящий, и после буйной перестрелки в дорогом отеле загоняет его на старый склад.

Подруга Мотоко по имени Куртен зовёт её в больницу, где работает: маленькой девочке пересадили сердце, но семья донора не припомнит, чтобы соглашалась его отдавать. Услышав эту историю, Арамаки велит выяснить, не тянется ли ниточка к мафиозным торговцам органами с чёрного рынка.

Мотоко заходит в сетевой чат, посвящённый Смеющемуся человеку, в надежде выудить что-то новое. Но находит лишь горячие споры самопровозглашённых «фанатов» и почти никаких настоящих улик.

Марко Аморетти, бывший флотский старшина из Американской империи, объявился в Японии и творит жестокие зверства над женщинами. В деле 9-му отделу помогает имперское ЦРУ, что многим не по душе, а самого Бато случай бьёт по больному — старые кошмары прошлого поднимают голову.

Тогуса под прикрытием проникает в больницу для страдающих синдромом закрытого кибермозга — лечебницу, полностью отрезанную от связи с внешним миром.

Одна из Тачиком решает прогуляться по городу. Она встречает девочку Мики, потерявшую собаку, и берётся ей помочь, а по пути находит странную коробку.

На совещании Арамаки показывает фото девушки, как две капли воды похожей на Эку Токуру — дочь главы «Токура Электроникс», похищенную шестнадцать лет назад. Вот только снимок сделан всего два дня назад.

Китайское правительство предупреждает 9-й отдел, что в Японию, возможно, проник убийца, нацелившийся на знаменитого затворника-миллионера. Связаться с ним и предостеречь никак не удаётся, и отдел отправляется прямо к нему в резиденцию.

Майора начинают тревожить Тачикомы: их искусственный разум развился куда быстрее и не так, как ожидалось, — машины заговорили о собственной «индивидуальности».

Бато под прикрытием внедряется на военную базу, чтобы проследить за Зайцевым — некогда его кумиром, олимпийским серебряным призёром, а ныне подозреваемым в шпионаже. Они легко сходятся и на удивление хорошо ладят, но, узнав правду о своём герое, Бато встаёт перед тяжелейшим выбором.

На международной полицейской конференции в Лондоне Арамаки навещает былую возлюбленную, теперь торгующую вином. Она просит помочь ей покончить с махинациями в её фирме, но он отвечает, что это вне его полномочий, — и тут в здание врываются двое грабителей и берут их в заложники.

Арамаки приходит на похороны старого боевого товарища, где его встречает дочь покойного друга. Вскоре 9-му отделу поручают уберечь от убийства министра иностранных дел Китая.

Новое дело 9-го отдела — волна массовых похищений людей. Ходят слухи, что преступный синдикат добывает органы и торгует ими на чёрном рынке, и, вникая в дело, отдел понимает: времени почти не осталось.

Тогуса вновь идёт по следу Смеющегося человека, и на этот раз расследование выводит его на крупную корпорацию по производству микромашин и на некоммерческое общество «Подсолнух».

Раненого Тогусу везут в больницу на операцию, но он отчаянно пытается передать добытое остальным из 9-го отдела. Пока он борется за жизнь, дело подхватывают товарищи — вот только кое-кто во власти узнаёт о расследовании и совсем этому не рад.

Мотоко готовят к пересадке в новое кибертело, но, приступив к процедуре, врач ясно даёт понять, что живой её отпускать не собирается. Тем временем Арамаки получает тревожное известие: похищен его брат.

Смеющийся человек возвращается! И, как шесть лет назад, незаметно похищает главу «Серано Геномикс». 9-й отдел прибывает в его дом слишком поздно и бросается на поиски.

Правительство приказывает распустить 9-й отдел: Арамаки увозят, Тогусу арестовывают. Мотоко собирает оставшихся в штабе для последнего дела, и они готовятся к обороне, пока к базе 9-го отдела стягиваются элитные бойцы и боевые доспехи.

Как ни бьются уцелевшие бойцы 9-го отдела, правительственные силы вылавливают их одного за другим — вскоре остаются лишь Бато и Мотоко.

Вышедшему из тюрьмы Тогусе вручают бумаги о роспуске 9-го отдела. Оставшись без работы и в отчаянии, он тщетно ищет вести о товарищах и, решив, что терять больше нечего, отправляется свести счёты с виновником — но его останавливает не кто иной, как Бато.